克莱姆森大学：争夺大量的计算资源

克莱姆森大学遗传与生物化学系的Feltus实验室是一个由遗传学家、计算机科学家、计算机工程师和生物工程师组成的跨学科团队，他们将软件工程和计算生物学技术相结合，试图在人类和植物生物系统中做出有用的分子发现。

该实验室使用了生物信息学、统计学和数据科学方法来发现新的模式，系教授Alex Feltus说。“我们分析的生物数据集在万亿到千兆位的范围内，我们设计了优化了的数据密集型计算工作流，使的数据能够适合于各种不同的计算平台”，也包括一些商业云提供商的计算平台。

近年来，实验室一直致力于Kubernetes系统上运行的工作流开发工作。“我们相信Kubernetes将在未来的许多年内成为数据密集型计算的通用标准平台，这将使得我们能够将软件工程的努力集中在一个架构上面，”Feltus说。

Feltus说，生物数据库正在呈几何级数的规模增长，我们可以挖掘数据集，从生物学角度深入了解一些最大的医疗和粮食安全挑战。“即使是小型的生物实验室也经常需要大量的计算资源。，”他说。“研究人员很快就会想要提出千兆级别的生物学问题，这将会需要访问目前商业云中的大型计算机。而Kubernetes集群是进行大规模计算的优秀平台。”

在完全转向云计算之前，“生物学研究人员需要民主化的、免信贷的云沙箱，在那里人们可以大规模地设计和测试工作流，”Feltus说。“这些沙盒是至关重要的，因为90%的科学实验都会走向死胡同，这会导致在发现问题之前就耗尽了云信贷的预算。”

Feltus实验室正在与许多其他的研究团队合作，尝试将可扩展的资源融合到本地和云服务当中，而Kubernetes和容器将发挥巨大的作用。

（编辑：柳州站长网）

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